Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms