Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms