Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms