Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pmfbp1Q9WVQ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms