Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme3Q9WV85 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme3Q9WV85 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms