Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms