Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms