Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms