Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp16Q9WTR0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms