Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50bQ9WTJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50bQ9WTJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms