Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms