Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry2Q9R194 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry2Q9R194 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms