Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mpdu1Q9R0Q9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mpdu1Q9R0Q9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms