Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms