Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms