Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms