Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd1Q9QY80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms