Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp3Q9QY23 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms