Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms