Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Apbb1Q9QXJ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms