Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms