Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms