Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms