Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b2Q9JME5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms