Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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