Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms