Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms