Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms