Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms