Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nova1Q9JKN6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms