Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stx6Q9JKK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms