Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cyp39a1Q9JKJ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms