Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms