Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp5Q9JKD3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms