Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tuba8Q9JJZ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms