Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms