Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms