Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssna1Q9JJ94 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms