Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms