Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms