Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms