Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtaQ9JHK4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms