Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms