Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Rb1cc1Q9ESK9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms