Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms