Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms