Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lima1Q9ERG0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lima1Q9ERG0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms