Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn2Q9ER65 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms