Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms