Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Igdcc4Q9EQS9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Igdcc4Q9EQS9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms